Ничего оргстеклу не будет от уксусной и от щавелевой кислот, вы же разбавленные растворы будете применять. Щавелевая, кстати, более едучая, чем уксусная. Разбавленая ортофосфорная кислота тоже применима (можно купить в радиотоварах и разбавить). И эта кислота действительно замедляет процесс дальнейшего ржавения (в отличие от уксусной, лимонной, щавелевой) благодаря образованию прочной плёнки из фосфатов. А вот применять средство для удаления ржавчины из автомагазина не стоит, в нём помимо кислоты может содержаться ещё много чего, например соли цинка, которые могут на стекле осесть и сделать его мутным. И обязательно после химобработки линзу ополоснуть 3-5 раз чистой водой (если дистилированую достанете, то совсем хорошо будет).
Ну и напоследок, не стоит бояться химии. Большинство веществ, в том числе щавелевая кислота, абсолютно безобидны, если их не совать в рот и мыть руки перед едой.